Wendi Bacon
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Contributions
The following list includes only slides and tutorials where the individual has been added to the contributor list. This may not include the sum total of their contributions to the training materials (e.g. GTN css or design, tutorial datasets, workflow development, etc.) unless described by a news post.
GitHub Activity
Tutorials
- Transcriptomics / Trajectory Analysis using Python (Jupyter Notebook) in Galaxy
- Transcriptomics / Filter, Plot and Explore Single-cell RNA-seq Data
- Transcriptomics / Generating a single cell matrix using Alevin
- Transcriptomics / Bulk RNA Deconvolution with MuSiC
- Transcriptomics / Pre-processing of 10X Single-Cell RNA Datasets
- Transcriptomics / Filtrado, representación y exploración de secuenciación de ARN de células únicas
- Transcriptomics / Generación de una matriz de datos de secuenciación de ARN de células únicas utilizando Alevin
Slides
- Transcriptomics / Plates, Batches, and Barcodes
- Introduction to Galaxy Analyses / Una breve introducción a Galaxy
- Transcriptomics / Introducción al análisis de datos de scRNA-seq
News
¡El primer tutorial en español ya está disponible! Galaxy siempre ha tenido tutoriales traducidos automáticamente mediante Google-Translate, ahora nos estamos embarcando en un nuevo proyecto para estudiar la experiencia de aprendizaje con tutoriales en bioinformática traducidos por humanos. Nuestro objetivo es crear un paquete de tutoriales para el análisis de datos single-cell (célula única) en primera instancia, con el fin de estudiar su uso y utilidad en un taller para hablantes nativos de español. Agradecemos enormemente a las nuevas participantes Patricia Carvajal López y Alejandra Escobar-Zepeda (EMBL-EBI) así como a las miembros existentes de GTN Beatriz Serrano-Solano (University of Freiburg), Saskia Hiltemann & Helena Rasche (Erasmus-MC), por su arduo trabajo en este proyecto de traducción y mantenimiento y, por supuesto, a Wendi Bacon (The Open University/EBI) como líder de proyecto.
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